顕微鏡画像解析
- 胞子発芽菌糸長測定プログラム（準備中）
分類学
- MEGA https://www.megasoftware.net/
- MAFFT version 7 https://mafft.cbrc.jp/alignment/server/
- IQTree http://www.iqtree.org/
- FigTree https://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/
- TreeBASE https://www.treebase.org/treebase-web/home.html
- Mycobank https://www.mycobank.org/
- T-BAS https://tbas.cifr.ncsu.edu
集団遺伝学
- GenAlEx https://biology-assets.anu.edu.au/GenAlEx/Welcome.html
- StructureSelector https://lmme.ac.cn/StructureSelector/
- Population genetics and genomics in R https://grunwaldlab.github.io/Population_Genetics_in_R/index.html
プライマー設計
- Primer3 https://bioinfo.ut.ee/primer3/
- PrimerExplorer（LAMP法） https://primerexplorer.jp/
- Oligo Calculator https://www.ngrl.co.jp/tools/0217oligocalc.htm
BLAST検索
- UNITE > RunAnalysis https://unite.ut.ee/analysis.php
菌株保存機関
- 農業生物資源ジーンバンク (MAFF株) https://www.gene.affrc.go.jp/databases-micro_search.php
- 製品評価技術基盤機構 NITE (NBRC株) https://www.nite.go.jp/nbrc/catalogue/?lang=ja
- Westerdijk Institute – KNAW (CBS株) https://wi.knaw.nl/Collection
- American Type Culture Collection (ATCC株) https://www.atcc.org/
- World Phytophthora Collection at the University of California, Riverside (WPC株) https://microplantpath.ucr.edu/world-phytophthora-collection-university-california-riverside
- International Collection Of Microorganisms (ICMP株) https://scd.landcareresearch.co.nz/
植物病原菌に関する情報検索
- 日本植物病名データベース https://www.gene.affrc.go.jp/databases-micro_pl_diseases.php
- USDA Fungal Databases https://fungi.ars.usda.gov/
- IDPhy: Molecular and Morphological Identification Phytophthora based on the types https://idtools.org/phytophthora/index.cfm
- Forest Phytophthoras of the World https://forestphytophthoras.org/
調査地に関する情報検索
- ぎふ森林情報WebMAP https://experience.arcgis.com/experience/d05d579ef68240d894052c3b04190d58/?draft=true
- 岐阜県 県域統合型GISぎふ https://gis-gifu.jp/gifu/Agreement?IsPost=False&MapId=4&RequestPage=%2fgifu%2fMAP%3flinkid%3d06cb7dd3-44c0-473b-840f-b4329e6fd6e9%26mid%3d4%26
- 岐阜県の生活環境保全林一覧 https://www.pref.gifu.lg.jp/page/6256.html
- 日本土壌インベントリー https://soil-inventory.rad.naro.go.jp/
植物の名称
- 植物和名ー学名インデックス YList http://ylist.info/index.html
論文検索
- Connected Papers https://www.connectedpapers.com/